ご質問有難う御座います。
現在使用されている塗料はVOC（揮発性有機化合物）の規制が掛かっており、基準値以下の塗料が流通しています。
外壁の塗料などは、溶剤系の物から水溶性に変わりつつあります。
室内用ですと、リボスやオスモなどの海外メーカーの自然塗料や、国内ではBATONなど、植物油を主原料とした塗料が数多く出ています。
中には食品衛生法の基準値を満たした塗料もあります。
外部にも使用できるのですが、耐久性が低く、耐用年数があまり長くありませんので、外部の塗料に関しては耐久性を求める限り完全な自然塗料は難しいと思います。
ですが、昔の『ペンキ』と違い匂いも少なくなってきています。匂いが少ないという事は、揮発する物質が少ないと言うことですので、人体への影響も少なくなっていると言えるでしょう。
ご提案させて頂く際に各塗料のデータも提示致しますので、安心してお住まいになれるリフォームのご提案が出来ると思います。